Même si tu as des espèces différentes, si les sexes sont différents tu as des risques d'hybridation > ca donne des bâtards. C'est pas forcément ce qu'il y a de plus grave.
Il y a surtout risque de contamination d'une espèce vers une autre. En particulier, et c'est l'exemple qui vient tout le temps, tu as des espèces porteuses saines de rhinites, et d'autres qui y sont très sensibles. Les mettre ensemble c'est prendre le risque d'en voir devenir malades, voir de mourir.
Bref, raisons sanitaires.
Ensuite il peut y avoir des différences de maintenance également.