identificayion tortue

Ah... Dommage !

Merci de l'info, Tetris.

Plutonia a écrit:

Ah... Dommage !

Merci de l'info, Tetris.

De rien

J'ai fait une demande de tarif chez Genindexe, je communiquerai leur réponse ici si j'en ai une.

Tu en auras une

Effectivement j'ai eu une réponse très rapidement et je vous la livre:

Bonjour Mr xxxxxxxx,

Oui nous pouvons réaliser un test par séquençage permettant de différencier différentes sous-espèces (ou espèces) de tortues (T. hermannii hermannii, T.hermannii boettgeri, T. graeca graeca, T. graeca ibera, et T. marginata). Toutefois, ce test ne permet pas d'identifier les individus hybrides !
Le tarif par individu est de 130€HT (156€ TTC).

N'hésitez pas à revenir vers moi si vous souhaitez un devis.


Bien cordialement

Dxxxx Sxxxxxxxxx

rien compris...

Il dit qu'il peut identifier les sous espèces de testudo et ensuite que les hybrides non...or il suffit que le séqueçage ne corresponde pas à une sous-espèce classique...Ca me semble un peu bidon et cheros !
Enfin je ne suis pas biologiste!

Je suppose que le compte-rendu du résultat fait figurer un commentaire qui déclare l'individu comme hybride et donc non identifiable.

Il faudrait peut être d'abord se poser la question de savoir si le terme "hybridation" a le même sens dans un laboratoire d'analyse et dans un forum.
Nous avons pris l'habitude d'utiliser ce terme dans un sens large mais une tortue issue d'une hermanni hermanni et d'une boettgeri c'est plutôt du  "métissage".

Buffalon a écrit:

Au final voilà ce que cela donne quand on fait le test génétique :

Effectivement, Buffalon, le terme "hybride" ne recouvre peut-être pas la même signification...

Peuvent-ils déterminer un mélange entre les deux sous-espèces Testudo hermanni hermanni, et Testudo hermanni boettgeri ?

J'ai demandé des précisions à ce sujet hier, j'attends la réponse.

Je n'ai donné que la ligne comportant le résultat final.

Elle est précédée d'une page d'alignement de séquences du gène mitochondrial qu'un profane comme moi ne comprend pas, puis en second page se trouve l'interprétation scientifique de cet alignement de séquences avec son pourcentage de ressemblance par rapport au code ADN type des THB.

Je vous livre la réponse qui a été faite à la demande suivante:

Q : Le but de ma demande serait de pouvoir "éliminer" tout individu pressenti pour de la reproduction et qui présenterait des traces d'hybridation.  .../... Lorsque vous écrivez "Toutefois, ce test ne permet pas d'identifier les individus hybrides" je suppose que cela signifie que vous ne pouvez pas les affecter à telle ou telle espèce mais face à ces sujets est-ce que votre compte-rendu précise que l'individu est hybridé et dans quelles proportions ?


R : La technique repose sur le séquençage d'un gène de l'ADN mitochondrial. Or ce type d'ADN est hérité uniquement par voie maternelle.Donc si l'on analyse un individu hybride T hermanii hermanii(mère) x T hermannii boettgeri(père), le résultat final sera T hermannii hermannii.
Ce commentaire est présent sur les rapports d'analyse.
J'espère avoir répondu à votre question ?
Si vous souhaitez d'autres informations n'hésitez pas à me contacter par téléphone au numéro ci-dessous.
Bien cordialement

Je pense que je vais appeler ce biologiste pour avoir une réponse claire, car en l'état, je ne vois pas du tout l’intérêt de faire pratiquer ce test.


PS: lorsque j'écris "éliminer" j'entends écarter d'un groupe reproducteur bien sur, n'allez pas me fusiller en place publique. D'autant que je ne pose cette question que pour info n'ayant aucune intention de me lancer dans un programme de reproduction mis à part pour mon plaisir perso et celui de quelques proches. "Des "Boettgeri" ... rien que des "Boettgeri", pour le plaisir et ... faire plaisir" pour citer Buffalon.

Message à l'attention d'un modérateur: la discussion s'écartant un peu du sujet initial, serait-il possible de la copier et de la placer dans un sujet traitant des tests génétiques ? Peut-être que ces échanges pourraient intéresser d'autres membres ?

Je viens d'avoir un entretien téléphonique très intéressant avec le Dr D. S*******. Il en ressort qu'il ne leur est pas possible de faire un diagnostic d'hybridation chez un individu. J'ai eu droit à tout un tas d'explications génétiques et statistiques sur la raison. Explications auxquelles je l'avoue je n'ai pas compris grand-chose mais seule la conclusion m'intéressait. L'analyse d'ADN mitochondrial sur nos tortues ne permet que de donner une identification d'espèce qui, en l’occurrence, correspond à celle de la mère. Exemple mère Boett x père Hermanii => le test génétique diagnostiquera des bébés Boett. Mère Hermanii x père Boett => le test identifiera des bébés Hermanii. Du coup, aucun intérêt pour les éleveurs amateurs. Dépenser plus de 150 euros pour apprendre uniquement la variété de la génitrice de sa tortue c'est cher payé pour si peu.

Par contre, il existe des tests de filiation. Ces tests coutent une soixantaine d'euros. Ils consistent à faire une empreinte génétique des sujets reproducteurs et, par comparaison avec celle des descendants, d'être en mesure de prouver sans aucune contestation possible la filiation des juvéniles. Un peu l'équivalent du LOF chez les chiens et les chats. Cette traçabilité pouvant faire foi en cas de mise en doute des administrations dont les éleveurs de tortues dépendent.

Tetris a écrit:

Je viens d'avoir un entretien téléphonique très intéressant avec le Dr D. S*******. Il en ressort qu'il ne leur est pas possible de faire un diagnostic d'hybridation chez un individu. J'ai eu droit à tout un tas d'explications génétiques et statistiques sur la raison. Explications auxquelles je l'avoue je n'ai pas compris grand-chose mais seule la conclusion m'intéressait. L'analyse d'ADN mitochondrial sur nos tortues ne permet que de donner une identification d'espèce qui, en l’occurrence, correspond à celle de la mère. Exemple mère Boett x père Hermanii => le test génétique diagnostiquera des bébés Boett. Mère Hermanii x père Boett => le test identifiera des bébés Hermanii. Du coup, aucun intérêt pour les éleveurs amateurs. Dépenser plus de 150 euros pour apprendre uniquement la variété de la génitrice de sa tortue c'est cher payé pour si peu.

Par contre, il existe des tests de filiation. Ces tests coutent une soixantaine d'euros. Ils consistent à faire une empreinte génétique des sujets reproducteurs et, par comparaison avec celle des descendants, d'être en mesure de prouver sans aucune contestation possible la filiation des juvéniles. Un peu l'équivalent du LOF chez les chiens et les chats. Cette traçabilité pouvant faire foi foi en cas de mise en doute des administrations dont les éleveurs de tortues dépendent.

Super intéressant, et fort bien résumé, Tetris !
Merci de cette information et de la synthèse !