Peut être faudrait-il les séparer au moins un moment, que la petite soit rassurée. Elle a peut être tout simplement peur des 2 grandes et peut être ne mange-t-elle pas suffisamment à cause de ça.
Certaines tortues sont beaucoup plus petites que d'autres également et si elle te semble vive et en bonne santé (nez sec, yeux ronds noirs et bien brillants), c'est que c'est un petit gabarit.
A l'occasion tu pourrais faire analyser une crotte pour vérifier qu'elle n'est pas parasitée.